大部制改革缺点是权力膨胀。顺德大部制改革面临以下困难:①主要部门与省市相关部门的对接存在问题，顺德有多个部门对抗一个上级部门；（2）大部制意味着权力的集中，监督权力的难度大大提高；③部分垂直管理部门调整为区级管理，答:在国务院机构“大部制”改革中，确立了以实施大部制和推进政府职能转变为主要特征和目标的新阶段政府机构改革:政府机构改革。
将国家发展和改革委员会全称改为国家发展和改革计划委员会。要探索职能有机统一的大部门制。十一届全国人大四次会议公布了国务院机构改革方案，其中指出，国务院将对新成立的国务院机构改革后的工业和信息化部、交通运输部、人力资源和社会保障部、环境保护部和住房和城乡建设部进行机构改革。国务院由工业和信息化部、人力资源和社会保障部、环境保护部、住房和城乡建设部以及交通运输部组成。
大部制改革有利于精简机构，解决机构臃肿，消除人浮于事。它可以在一定程度上简化普通人的程序，使其真正方便人民，做一件事没必要跑几个部门，部门之间互相推诿踢皮球。撤销科技部，国家发展和改革委员会（NDRC）进一步接管了权力并改变了NDRC的职责。党的十七大报告指出，全面取消国家发展和改革委员会对微观管理实践和具体审批事项的权力，逐步将其主要职能转变为制定和研究宏观规划。
